תומפסון היה אמור להיות מוצא להורג ב-13 באוקטובר בבית הכלא המדינתי ברייפורד. ביום חמישי בערב משך דה-סנטיס את הצו, לאחר שכבר הורה לעכב זמנית את ההוצאה להורג ולמנות שלושה רופאים שיבדקו את מצבו. מסקנותיהם של הרופאים - וייד מאיירס, טוניה ורנר ואמילי לזרו - לא פורסמו, ולא ברור אם הן שהובילו לביטול הצו.
הרצח שבגינו נידון תומפסון למוות התרחש ב-1976 במלון במיאמי. לפי התביעה, תומפסון, שהיה אז בן 23, ורוקו ג'יימס סוראס, שהיה בן 30, עינו את סאלי אייבסטר בת ה-23: הם הכו אותה בשרשראות, צרבו אותה בסיגריות ותקפו אותה באמצעות רגל של כיסא. היא מתה בהמשך מהלם ומפגיעות פנימיות, והמשטרה תיארה אז את המקרה כ"רצח האכזרי ביותר במחוז דייד".

מושל פלורידה רון דה-סנטיס ביטל את ההוצאה להורג של ויליאם לי תומפסון
שני הגברים הודו ברצח ונידונו למוות, אך בעקבות ערעוריהם הוחלט לערוך להם משפטים חדשים. תומפסון הודה שוב וב-1978 נגזר עליו פעם נוספת עונש מוות. סוראס הורשע ברצח מדרגה שנייה ונידון ל-203 שנות מאסר; הוא מת בכלא ב-1993. תומפסון נותר בכלא, ובחודשים האחרונים נזקק לאשפוזים ולטיפול נרחב בשל אלח דם, אי-ספיקת לב, תת-תזונה קשה ופצעי לחץ מרובים.
ב-10 בספטמבר שוחרר תומפסון מבית החולים שאנדס בגיינסוויל. לפי הדיווח באתר Florida Trib, בבית החולים הבינו שהוא יוחזר ליחידה הרפואית בכלא, אך כעבור 24 שעות בלבד, לאחר שדה-סנטיס חתם על הצו להוצאתו להורג, הוא הועבר ממנה לאגף שבו מוחזקים אסירים הממתינים לביצוע גזר הדין. זהו אגף בעל הגבלות מחמירות בעיר סטארק, ולפי הדיווח, תומפסון היה האסיר הראשון במצב רפואי קשה כל כך שהוחזק בו.
עורכי דינו פנו לבית המשפט בניסיון לחייב את המדינה להעבירו למתקן שבו יוכל לקבל טיפול רפואי. במסמכים שהגישו הסתמכו על בדיקה שערך חודשים קודם לכן הנוירופסיכולוג רוברט וואו, שמצא פגיעה קשה בתפקודו הקוגניטיבי. "הוא לא הבין שנגזר עליו עונש מוות ולא הצליח להפגין הבנה ממשית של מצבו הנוכחי", כתב המומחה. לדבריו, תומפסון היה מבולבל, חזר שוב ושוב על כך שהוא סובל מכאבים עזים, ובעת הבדיקה היה כבול לכיסא גלגלים וחלש מכדי להניע בחופשיות את גפיו.
גם אנשי הצוות הרפואי בכלא תיעדו בלבול, הליכה לא יציבה ושינוי במצבו המנטלי. לפי הרישומים, תומפסון חשב ש"בוש" הוא נשיא ארה"ב, ובמקרה אחר לא הצליח להשיב בעל פה לשאלה של אחות. המדינה דחתה את בקשת עורכי דינו להעבירו למתקן שבו יקבל טיפול, אך דה-סנטיס הורה בהמשך על עיכוב זמני ועל הבדיקה הנוספת. ברקע עומד גם האיסור בחוקי פלורידה ובדין הפדרלי להוציא להורג אדם עם מוגבלות שכלית.
גרייס האנה, מנכ"לית הארגון Floridians for Alternatives to the Death Penalty, בירכה על ביטול הצו וכינתה אותו "ההחלטה הנכונה". "מר תומפסון חולה מאוד, אינו כשיר להוצאה להורג וסובל ממוגבלות שכלית", אמרה. לדבריה, "הוצאתו להורג הייתה הפרה בוטה של התיקון השמיני לחוקה ופגיעה בכבוד האדם".