
ההסבר נמצא במלנין – הפיגמנט שנותן לעיניים את צבען. ככל שיש יותר מלנין בקשתית, כך היא מסוגלת לספוג יותר אור ולהפחית את כמות האור שחודרת לעין. בעיניים כחולות יש פחות מלנין, ולכן יותר אור חודר פנימה, מה שעלול לגרום לסנוור ולתחושת אי־נוחות בתנאי תאורה חזקה.

עם זאת, חשוב להדגיש שלא כל אדם עם עיניים כחולות יסבול מרגישות לאור. מדובר בנטייה כללית בלבד, ועוצמת הרגישות משתנה מאדם לאדם. גורמים נוספים, כמו יובש בעיניים, מיגרנות, דלקות או מחלות עיניים שונות, יכולים גם הם לגרום לרגישות לאור – ללא קשר לצבע העיניים.
לדברי מומחי עיניים, עבור רוב האנשים מדובר בעיקר באי־נוחות ולא בבעיה רפואית. במקרים רבים שימוש במשקפי שמש עם הגנת UV, הימנעות מחשיפה ממושכת לשמש והפחתת סנוור יכולים להקל משמעותית על התחושה. עם זאת, אם הרגישות מופיעה באופן פתאומי, מלווה בכאב, ירידה בראייה או כאבי ראש חזקים, מומלץ להיבדק אצל רופא עיניים כדי לשלול מצב רפואי אחר.
למרות החיסרון הזה, לעיניים כחולות יש גם יתרון אפשרי. כמה מחקרים מצביעים על כך שבעלי עיניים בהירות עשויים לראות טוב יותר בתנאי תאורה חלשים, כנראה משום שפחות פיגמנט מאפשר לקלוט יותר אור. עם זאת, החוקרים מדגישים שהיתרון הזה אינו משמעותי בחיי היומיום, והוא אינו משנה את ההמלצה להגן על העיניים מפני שמש חזקה – בלי קשר לצבע שלהן.