
סנדרס מונה בשנת 2007 למועצת מוזיאון השואה של ארה"ב, גוף שמקיים שתי ישיבות רשמיות בשנה ומורכב מ-55 חברים שממונים על ידי הנשיא, לצד עשרה נציגים של הסנאט ובית הנבחרים. לפי הרישומים, הוא החסיר את כל הישיבות מאז מינויו. אחד מחברי המועצה, עו"ד רוברט גרסון, אמר כי מדובר במפגשים שאליהם מגיעים חברים מכל רחבי המדינה, והוסיף שסנדרס, שפועל דרך קבע בוושינגטון, לא טרח להגיע אף פעם. חבר מועצה נוסף, איש העסקים ג’ונתן בורקן, העיר בציניות כי המספר 18 הוא מספר סמלי ביהדות, אך "ממש לא במקרה הזה".

ברני סנדרס לא השתתף באף פגישה במועצת מוזיאון השואה של ארה"ב, במשך כל 18 שנות כהונתו
הביקורת כלפי סנדרס הובילה למכתב שנשלח למנהיג המיעוט הדמוקרטי בסנאט, צ'אק שומר, בדרישה להחליפו. על המכתב חתומים כתריסר חברי מועצה, בהם מינויים של דונלד טראמפ ושל ג’ו ביידן. מעבר להיעדרות הממושכת, הם מציינים גם את התבטאויותיו של סנדרס בנוגע לישראל, ובפרט את טענותיו כי ישראל מבצעת רצח עם ברצועת עזה. במכתב נכתב כי בתקופה של עלייה באנטישמיות ובהכחשת שואה, נדרש שחברי המועצה יהיו מעורבים ויתמכו באופן מלא במשימת המוזיאון.
גם חברי מועצה דמוקרטים הביעו ביקורת. אלכס הקלר, פעיל ותיק במפלגה הדמוקרטית שמונה לתפקיד על ידי ביידן, אמר כי עמדותיו הפומביות של סנדרס אינן משקפות את ייעוד המוזיאון, והוסיף כי במשך שנות כהונתו הוא עצמו לא ראה את סנדרס באף ישיבה. חבר מועצה נוסף, ג’ימי רזניק, תהה מדוע להחזיק בתפקיד אדם שאינו מגיע.
בלשכתו של סנדרס לא נמסרה תגובה, וגם שומר לא השיב לפניות. לא ברור אם יינקט צעד ממשי להחלפתו, אם כי קיימת אפשרות שגם נשיא הסנאט הזמני, צ'אק גרסלי, יוכל לבצע את המינוי. סנדרס, עצמאי-פרוגרסיבי שמצביע עם הדמוקרטים, הוא אחד מעשרה סנאטורים יהודים מכהנים, ומבקריו טוענים כי יש מועמדים רבים אחרים שיוכלו למלא את התפקיד באופן פעיל יותר.
הפרשה מתרחשת על רקע הביקורת החריפה שמוביל סנדרס נגד ממשלת ישראל. בחודשים האחרונים הוא האשים את ישראל בביצוע רצח עם, ובספטמבר האחרון פרסם הצהרה ארוכה שבה כתב כי "הכוונה ברורה והמסקנה בלתי נמנעת". הוא גם נשבע אמונים לראש עיריית ניו יורק זוהראן ממדאני, והביע בעבר תמיכה בצעדים פליליים נגד ראש הממשלה בנימין נתניהו.
סנדרס אינו הסנאטור היחיד שנעדר מישיבות המועצה. הסנאטורית ג'קי רוזן השתתפה רק בשתי ישיבות מתוך עשר האחרונות, והסנאטור טים סקוט החסיר 13 ישיבות, אם כי השתתף בעבר. הסנאטור ריק סקוט מונה לאחרונה ועדיין לא נכח בישיבה, אך תרם חלק משכרו למוזיאון. אחד מחמשת המושבים שמיועדים לבחירת הסנאט נותר כיום פנוי.